Selain di pemerintahan, ia juga berada di BUMD (Badan Usaha Milik Daerah). Di mana sosok kader NU tersebut merupakan Komisaris PT Transjakarta. Ia menduduki jabatan tersebut bersama dengan Zudan Arif Fakrulloh yang kini juga menjabat sebagai Kepala Badan Kepegawaian Negara (BKN).
Kemudian di posisi yang sama dengan Ainul Yakin, ada nama mantan anggota DPR RI sekaligus eks jubir KPK yakni Johan Budi Sapto Prabowo. Selain itu ada juga mantan Wadir Politik Badan Intelijen dan Keamanan (Baintelkam) Polri Irjen Pol (purn) Lucky Arliansyah.
Sementara untuk jabatan Komisaris Utama di PT Transjakarta adalah mantan Panglima Komando Daerah Jayakarta (Kodam Jaya) Mayjen TNI (purn) Untung Budiharto.
Kembali ke Ainul Yakin, tokoh muda Nahdliyyin ini juga pernah maju dalam bursa Pileg DPR RI periode 2024-2029. Ia maju dari Partai Golkar untuk dapil DKI II dengan nomor urut 4. Sayangnya, ia gagal melenggang ke Senayan.
Dari sisi akademik, Muhammad Ainul Yakin merupakan peraih gelar doktor dalam Ilmu Alquran dan Tafsir dari Institut PTIQ Jakarta (Perguruan Tinggi Ilmu Alquran) tahun 2024 lalu. Di mana kampus tersebut dipimpin oleh Prof Nasaruddin Umar yang notabane sebagai Rekror PTIQ Jakarta serta Menteri Agama RI dimana Muhammad Ainul Yakin sekarang belerja sebagai Tenaga Ahli.
