Pada tahun 2001, sejak Clinton meninggalkan Gedung Putih, ia menghadapi masalah kesehatan. Tahun 2004, ia menjalani operasi bypass sebanyak empat kali lipat setelah mengalami nyeri di dada yang berkepanjangan dan sesak napas. Tahun 2005, ia kembali ke rumah sakit untuk operasi paru-paru karena kolaps sebagian, dan pada tahun 2010 ia memasang sepasang stent di arteri koronernya.
Clinton pernah berkata, kalau ia telah mengubah pola makannya menjadi vegan dan membuat ia kehilangan berat badannya dan melaporkan peningkatan kesehatannya.
Ia berkali-kali kembali ke podium untuk berkampanye para calon Demokrat, terutama istrinya Hillary Clinton. Tahun 2008 Hillary gagal untuk maju menjadi Presiden Amerika Serikat.
Seorang juru bicara Yayasan Clinton, mengatakan mantan Presiden berada di daerah Los Angeles untuk acara pribadi yang terkait dengan organisasi amalnya.